Zgnilizna szyjki cebuli jest chorobą grzybową. Patogen zimuje w postaci grzybni na resztkach porażonych roślin pozostawionych na polu po zbiorze cebuli. Rozwojowi choroby sprzyjają częste opady deszczu, przenawożenie nawozem azotowym, uszkodzenie roślin przez owady, a także rany powstające w trakcie zbioru i transportu. Objawami choroby są gnijące, mięsiste jasne łuski, jakby nasiąknięte wodą . W miarę rozwoju choroby gnijące łuski ciemnieją, a na ich powierzchni widoczny jest szary nalot trzonków konidialnych. Na zgniłych łuskach zauważyć można kuliste, chropowate, czarne sklerocja grzyba.
Jak uniknąć choroby:
- należy stosować zdrowe nasiona do wysiewu
- należy przeorać resztki roślinne
- należy unikać upraw warzyw cebulowych po sobie
- należy usuwać porażone cebule